Üye işyeri tarafından bir ödeme iade edildiğinde, kesilen iyzico komisyon tutarları da aynı şekilde üye işyerine iade edilmektedir.
İade sırasında üye işyerinin bakiyesinden, ödemeden üye işyerine gönderilen tutar kadar bakiye düşmekte ve kesilen iyzico komisyon tutarları iade sırasında eklenerek son kullanıcının kartına tahsil edilen tutarın tamamı iade edilmektedir.
Bu iade edilen komisyon tutarı da ek olarak iadenin yapıldığı ayın raporlarına "Refund" olarak yansıtılmakta ve yine o ayın fatura tutarından düşülmektedir.